Lo que dice el titulo, en vista de que el mkv esta poco a poco entrando en el fansub, dejo este tuto de como reproducir el MKV de manera facil y sencilla.
1. Desinstalar cualquier paquete de codecs que tenga, ya que podrian haber conflictos con el nuevo que van a instalar.
2. Instalar el CoreAVC, que es un decoder para h264 conocido por ser ligero y versátil, por lo que vendra bien en maquinas antiguas 
http://www.megaupload.com/?d=YHP247TS
3. Una vez instalado, lo único que debemos hacer es configurarlo de la siguiente manera:
pd: Puede que en algunas pc’s salga la opción cuda, si es así activarla en lugar de dxva.
4.Descargar el CCCP, acá lo pueden hacer http://www.cccp-project.net/, es el paquete de codecs más completo y funcional para nuestro propósito, una vez descargado instalar, después les va a salir esta ventana:
hay que asegurarse que este activada la opción señalada en rojo
5. Al darle next, aparecerán otras configuraciones, que deben quedar así:
6. Eso seria todo, ahora, para asegurarse de que todo quedo bien, abrir un archivo en mkv, en este caso se hizo con el capitulo de Nichijou, el archivo debe abrise con el MPC-HC, que si todo lo anterior lo hicieron bien, debe ser el reproductor default, al abrir el archi y darle clic derecho y luego en filters, deben aparecer así:
tambien, en la barra de tareas deben aparecer estos tres icono, señal de que todo lo hicieron bien:
PD:Este metodo fue probado en una pc vieja, si ni aun asi reproduce bien, hay que comprar otra pc 
